O acompanhamento psicopedagógico parte das questões investigadas no diagnóstico. Através de actividades variadas pretende-se vencer os obstáculos que se impõem ao processo de aprendizagem para que a criança/jovem possa retomá-lo com maior autonomia e sucesso. O trabalho psicopedagógico visa desencadear novas necessidades, de modo a provocar o desejo de aprender e não somente uma melhoria no rendimento escolar. Durante o acompanhamento são estabelecidos contactos periódicos com a equipa escolar (coordenador e professores) e responsáveis pela criança e/ou adolescente, visando maior integração entre terapeuta-escola-família.